
Điểm mới về phân loại hồ sơ hoàn thuế tại Thông tư 89/2026/TT-BTC (Hình minh họa)
Ngày 10/8/2026, Cục Thuế ban hành Công văn 5746/CT-CS về việc giới thiệu điểm mới Thông tư 89/2026/TT-BTC.
Theo đó, điểm mới về phân loại hồ sơ hoàn thuế tại Thông tư 89/2026/TT-BTC (Điều 48) như sau:
1. Sửa đổi quy định về phân loại hồ sơ hoàn thuế thuộc diện kiểm tra trước tại trụ sở người nộp thuế đối với hồ sơ hoàn thuế lần đầu của dự án đầu tư là phân loại theo từng dự án đầu tư (điểm a.1.1 khoản 1).
Trước đây, quy định tại điểm a khoản 1 Điều 33 Thông tư 80/2021/TT-BTC phân loại hồ sơ hoàn thuế thuộc diện kiểm tra trước tại trụ sở người nộp thuế đối với hồ sơ hoàn lần đầu được thực hiện theo từng trường hợp hoàn thuế, chưa có quy định phân loại hoàn lần đầu theo từng dự án đầu tư.
2. Bổ sung quy định phân loại hồ sơ hoàn thuộc diện kiểm tra trước tại trụ sở người nộp thuế đối với hồ sơ hoàn thuế lần đầu của cơ sở kinh doanh sản xuất hàng hóa, cung cấp dịch vụ chịu thuế suất thuế giá trị gia tăng 5% (điểm a.1.3 khoản 1).
3. Sửa đổi quy định rõ về phân loại hồ sơ hoàn thuộc diện kiểm tra trước tại trụ sở người nộp thuế đối với hồ sơ hoàn thuế được xác định có rủi ro cao trong quản lý thuế áp dụng đối với trường hợp: hoàn thuế giá trị gia tăng đối với dự án đầu tư; hoàn thuế giá trị gia tăng đối với xuất khẩu; hoàn thuế giá trị gia tăng đối với cơ sở kinh doanh sản xuất hàng hóa, cung cấp dịch vụ chịu thuế suất thuế giá trị gia tăng 5%; hoàn thuế giá trị gia tăng thuộc chương trình, dự án sử dụng vốn hỗ trợ phát triển chính thức (ODA) không hoàn lại; hoàn thuế giá trị gia tăng đối với hàng hóa, dịch vụ mua trong nước bằng nguồn vốn viện trợ không hoàn lại không thuộc hỗ trợ phát triển chính thức của các cơ quan, tổ chức nước ngoài; hoàn thuế giá trị gia tăng đối với hàng hóa, dịch vụ mua trong nước bằng nguồn tiền viện trợ quốc tế khẩn cấp để cứu trợ và khắc phục hậu quả thiên tai tại Việt Nam; hoàn thuế tiêu thụ đặc biệt đối với xăng sinh học (điểm c.1 khoản 1).
Trước đây, chỉ quy định chung hồ sơ hoàn thuế thuộc loại rủi ro về thuế cao theo phân loại quản lý rủi ro trong quản lý thuế;
4. Bổ sung quy định phân loại đối với hồ sơ hoàn thuế có một phần số tiền đề nghị hoàn trong hồ sơ hoàn thuế được xác định có rủi ro cao trong quản lý thuế áp dụng đối với các trường hợp hoàn thuế áp dụng đối với trường hợp hoàn thuế giá trị gia tăng đối với dự án đầu tư; hoàn thuế giá trị gia tăng đối với xuất khẩu; hoàn thuế giá trị gia tăng đối với cơ sở kinh doanh sản xuất hàng hóa, cung cấp dịch vụ chịu thuế suất thuế giá trị gia tăng 5%; hoàn thuế tiêu thụ đặc biệt đối với xăng sinh học (điểm c.2 khoản 1).
5. Bỏ quy định phân loại hồ sơ hoàn thuế đối với 02 trường hợp: Hồ sơ hoàn thuế thuộc trường hợp hoàn thuế trước nhưng hết thời hạn theo thông báo bằng văn bản của cơ quan thuế mà người nộp thuế không giải trình, bổ sung hồ sơ hoàn thuế hoặc có giải trình, bổ sung hồ sơ hoàn thuế nhưng không chứng minh được số tiền thuế đã khai là đúng; Hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu không thực hiện thanh toán qua ngân hàng thương mại, tổ chức tín dụng khác theo quy định của pháp luật.